MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 7491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_013205	GAA	2	6	2627286	2627291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_013205	CCG	2	6	2627302	2627307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6503	NC_013205	GCC	2	6	2627333	2627338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6504	NC_013205	GTG	2	6	2627395	2627400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_013205	CCA	2	6	2627404	2627409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6506	NC_013205	GCCG	2	8	2627440	2627447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6507	NC_013205	TGT	2	6	2627509	2627514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_013205	GGA	2	6	2627523	2627528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_013205	GC	3	6	2627529	2627534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6510	NC_013205	CG	3	6	2627537	2627542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6511	NC_013205	GTC	2	6	2629845	2629850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6512	NC_013205	TCA	2	6	2631071	2631076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6513	NC_013205	GCG	2	6	2631138	2631143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_013205	ATC	2	6	2631154	2631159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_013205	GCC	2	6	2631192	2631197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6516	NC_013205	CGA	2	6	2633758	2633763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6517	NC_013205	GCG	2	6	2633768	2633773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_013205	CCT	2	6	2634337	2634342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6519	NC_013205	AG	3	6	2634379	2634384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_013205	ACG	2	6	2634451	2634456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6521	NC_013205	AGC	2	6	2634499	2634504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6522	NC_013205	TG	3	6	2634526	2634531	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_013205	CTATGA	2	12	2634590	2634601	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6524	NC_013205	GGA	2	6	2634612	2634617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_013205	CGC	2	6	2634627	2634632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6526	NC_013205	GCA	2	6	2634648	2634653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6527	NC_013205	AAG	2	6	2634726	2634731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_013205	GA	3	6	2634748	2634753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_013205	CCA	2	6	2634767	2634772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6530	NC_013205	ATGG	2	8	2634839	2634846	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_013205	GCG	2	6	2634863	2634868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6532	NC_013205	T	6	6	2634875	2634880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_013205	TC	3	6	2634949	2634954	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6534	NC_013205	GC	3	6	2634968	2634973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6535	NC_013205	TCCG	2	8	2635085	2635092	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6536	NC_013205	TCG	2	6	2635123	2635128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6537	NC_013205	CAA	2	6	2635313	2635318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6538	NC_013205	GA	3	6	2635414	2635419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_013205	GGA	2	6	2635436	2635441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_013205	CGCGC	2	10	2635458	2635467	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6541	NC_013205	CGAG	2	8	2635490	2635497	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6542	NC_013205	CGA	2	6	2635515	2635520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6543	NC_013205	ACG	2	6	2637322	2637327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6544	NC_013205	CAC	2	6	2637413	2637418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6545	NC_013205	ATC	2	6	2637506	2637511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6546	NC_013205	GCC	2	6	2637538	2637543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6547	NC_013205	GGAT	2	8	2637549	2637556	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_013205	GAA	2	6	2637712	2637717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_013205	CGA	2	6	2637724	2637729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6550	NC_013205	CGTC	2	8	2637733	2637740	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6551	NC_013205	ATG	2	6	2637786	2637791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_013205	CGAAC	2	10	2637975	2637984	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6553	NC_013205	CA	3	6	2638008	2638013	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6554	NC_013205	CGT	2	6	2638061	2638066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6555	NC_013205	TCGC	2	8	2638069	2638076	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6556	NC_013205	AGTC	2	8	2638082	2638089	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6557	NC_013205	TCA	2	6	2638104	2638109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6558	NC_013205	CGAGC	2	10	2638131	2638140	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6559	NC_013205	GC	3	6	2638139	2638144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6560	NC_013205	GCA	2	6	2638196	2638201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6561	NC_013205	GAA	2	6	2638220	2638225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_013205	AC	3	6	2638234	2638239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6563	NC_013205	A	6	6	2638254	2638259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_013205	GCC	2	6	2638390	2638395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6565	NC_013205	AAG	2	6	2639546	2639551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_013205	CT	3	6	2639655	2639660	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6567	NC_013205	TGTA	2	8	2639669	2639676	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_013205	CGCT	2	8	2639792	2639799	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6569	NC_013205	GCGA	2	8	2639805	2639812	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6570	NC_013205	TTCA	2	8	2639883	2639890	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6571	NC_013205	GAT	2	6	2639952	2639957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_013205	GAT	2	6	2640841	2640846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_013205	CCGC	2	8	2640849	2640856	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6574	NC_013205	TACA	2	8	2643154	2643161	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6575	NC_013205	CGC	2	6	2643167	2643172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6576	NC_013205	GAC	2	6	2643193	2643198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6577	NC_013205	GCTC	2	8	2643426	2643433	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6578	NC_013205	GAG	2	6	2643441	2643446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_013205	CTT	2	6	2645084	2645089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6580	NC_013205	CTC	3	9	2645955	2645963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6581	NC_013205	TTC	2	6	2645972	2645977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6582	NC_013205	GCG	2	6	2646022	2646027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6583	NC_013205	TGA	2	6	2647023	2647028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_013205	GAA	2	6	2649033	2649038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_013205	T	7	7	2649042	2649048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_013205	GGC	2	6	2649073	2649078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6587	NC_013205	TCG	2	6	2650176	2650181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6588	NC_013205	GC	3	6	2650941	2650946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6589	NC_013205	TCT	2	6	2655729	2655734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6590	NC_013205	TGA	2	6	2655741	2655746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_013205	CG	3	6	2655765	2655770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6592	NC_013205	A	7	7	2655775	2655781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_013205	CA	3	6	2655807	2655812	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6594	NC_013205	GCC	2	6	2655903	2655908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6595	NC_013205	CTCG	2	8	2655911	2655918	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6596	NC_013205	CCT	2	6	2657123	2657128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6597	NC_013205	GC	3	6	2657132	2657137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6598	NC_013205	AAAC	2	8	2657179	2657186	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6599	NC_013205	TCGT	2	8	2658031	2658038	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6600	NC_013205	CCTCGC	2	12	2658062	2658073	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
6601	NC_013205	CCGA	2	8	2658210	2658217	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6602	NC_013205	CCA	2	6	2658228	2658233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6603	NC_013205	TCCC	2	8	2661182	2661189	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6604	NC_013205	CG	3	6	2661196	2661201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6605	NC_013205	CG	4	8	2661205	2661212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6606	NC_013205	GAGAG	2	10	2662073	2662082	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_013205	AGG	2	6	2662118	2662123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_013205	GAGC	2	8	2662645	2662652	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6609	NC_013205	CCT	2	6	2663480	2663485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6610	NC_013205	GC	3	6	2663490	2663495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6611	NC_013205	GCC	2	6	2664354	2664359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6612	NC_013205	A	6	6	2664381	2664386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_013205	GACTT	2	10	2664398	2664407	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6614	NC_013205	GC	3	6	2664438	2664443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6615	NC_013205	CCA	2	6	2664561	2664566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6616	NC_013205	TTCGTG	2	12	2664600	2664611	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6617	NC_013205	GCAT	2	8	2664656	2664663	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6618	NC_013205	TCAC	2	8	2664678	2664685	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6619	NC_013205	CTT	2	6	2664754	2664759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6620	NC_013205	GCC	2	6	2664800	2664805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6621	NC_013205	GTC	2	6	2664868	2664873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6622	NC_013205	CCA	2	6	2664893	2664898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6623	NC_013205	CA	3	6	2664897	2664902	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6624	NC_013205	ACC	2	6	2665008	2665013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6625	NC_013205	GGT	2	6	2665021	2665026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_013205	TCG	2	6	2665159	2665164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6627	NC_013205	CGG	2	6	2665262	2665267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6628	NC_013205	CCA	2	6	2665285	2665290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6629	NC_013205	TCA	2	6	2665503	2665508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6630	NC_013205	CTT	2	6	2665513	2665518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6631	NC_013205	GTC	2	6	2665530	2665535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6632	NC_013205	GGA	2	6	2665567	2665572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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